Se contempla que operen en la frontera sur 23 coordinaciones regionales.

Chiapas contará con tres sectores que concentrarán 12 coordinaciones regionales, así como también son Tapachula Tonalá, Villaflores, Palenque, Bochil, Ocosingo, Las Margaritas, Huehuetán, Comitán de Domínguez y San Cristóbal de las Casas.

Campeche tendrá dos sectores con igual número de coordinaciones y dos sectores: ciudad del Carmen y Campeche. Tabasco contará con tres sectores, en los cuales habrá cinco coordinaciones regionales: Centro, Macuspana, Teapa, Cárdenas y Tenosique.

Mientras que Quintana Roo, tiene dos sectores con cuatro coordinaciones: Benito Juárez (Cancún), Cozumel, Solidaridad y Othón P. Blanco.

El mayor ingreso de migrantes al país  ha ocurrido por Tapachula, Chiapas, entidad que colinda con Guatemala, sin embargo, el gobierno federal no ha confirmado si los 6 mil elementos de la Guardia Nacional que enviarán a esta zona  a frenar la migración o en dichas coordinaciones.

Hasta el momento, el Servicio de Protección Federal desplegó a 103 policías para brindar seguridad en la Estación Migratoria Siglo XXI del Instituto Nacional de Migración, en Tapachula, Chiapas.